| Betydelsen av Paenibacillus polmyxa biofilm formation vid bildandet av skydd för växthusplantor mot Pythium root rot
Projektet är en fortsättning av FORMAS och VINNOVA financed projects: 2005-3196-4034-42 på Waterloo University, Canada och 2007-1690, 2007-275, 2008-01122 på SLU, Uppsala, Sweden
Forskningsperiod: Jan 2010- Dec 2013; Doktorandtjänst
Doktorandens (Yun Cao) lön för 4 år (a 500K) totalt 2000K är begärt för projektet.
Handledare: Salme Timmusk
Department of Forest Mycology & Pathology,
SLU, Uppsala Sweden
Box 7026; SE-750 07
Tel: +46 737015402
Fax: +46 18 673599
salme.timmusk@mykopat.slu.se
Biträdande handledare:
Prof. Roger Finlay
Department of Forest Mycology & Pathology,
SLU, Uppsala Sweden
Box 7026; SE-750 07
Tel: +46 737015402
Fax: +46 18 673599
Roger.Finlay@mykopat.slu.se
Biträdande handledare: Prof. Bernard R. Glick
Department of Biology, University of Waterloo
Waterloo, Ontario, Canada N2L 3G1
Tel: +519-888-4567 x32058
Fax: +519-746-0614
Email: glick@sciborg.uwaterloo.ca
http://www.science.uwaterloo.ca/departments/biology/people/glick/index.html
Pythium root rot är en av de tre mest förödande sjukdomar för växthus i Sverige. Den orsakar enorma ekonomiska förluster i grönsaksproduktionen likväl som i plantskolor. Ett flertal strategier har använts för att bekämpa sjukdomen. På grund av miljöbetingande bekymmer finns det betydande intresse att ersätta kemiska bekämpningsmedel med miljövälgörande biokontrolmedel. Vi planerar att studera den genetiska så väl som den fysiska yttre beskaffenheten av biofilmer formade av varierande Svenska, Israeli, Egyptiska och Kinesiska P. polymyxa arter. Vi har för avsikt att upplösa P. polymyxa arter förmåga att forma biofilm och att identifiera gener som är involverade i extracellulär matrix bildande.
Vi ska beskriva den extracellulär matrixen med FTIR och fastställa fysiska egenskaper med hjälp av AFM. Resultaten kommer att länkas till realtids PCR och ’high density microarray’ resultat om rhizosfärens mikrobiell struktur.
Med en sådan systematisk approach kommer vi att garantera P. polymyxa reproduktiva uppförande mot Pythium rotröta i växthus. Studien kommer att vara ett steg mot ett mer miljövänligt jordbruk, vilket minskar beroendet på bekämpningsmedel i Sverige. Eftersom det gemensamma uppförande hos bakterie resulterar i biofilm bildande och är vanligt bland olika bakteriearter kommer studien att belysa den psysiologiska, genetisk och fysiska egenskaper av biofilm bildning generellt.
|